İlki 1996 yılında Türkiye’de yapılan Karma Ekonomik Komisyon toplantılarının beşincisi 13-14 Mart 2008 tarihlerinde Ankara’da yapılmıştır.
7 Eylül 1999’da imzalanan ve 1 Ekim 2000’de yürürlüğe giren Serbest Ticaret Anlaşmasına (STA) göre Türkiye, anlaşmanın yürürlüğe giriş tarihinden itibaren Makedonya menşeli sanayi mallarına yönelik gümrük vergilerini sıfırlamıştır.
Söz konusu anlaşma uyarınca, Makedonya’ya Türkiye’den sanayi malları ithalatını serbestleştirmek için kademeli bir geçiş süreci tanınmıştır.
Buna göre, Makedonya Türkiye’den gelen sanayi mallarına uyguladığı gümrük vergilerini anlaşmanın yürürlüğe girdiği tarihte %90’a, 2006’da %60’a ve 2007’de %30’a indirmiş olup, söz konusu vergi oranları 1 Ocak 2008’de tamamen sıfırlanmıştır.
Makedonya, kuş gribi nedeniyle Türkiye’den tavukçuluk ürünleri ithalatını, AB’nin ihracat numarası uygulamasını aynen benimsemesi nedeniyle de süt ve süt ürünleri ithalatını durdurmuştur.
AB komisyonunun ısıl işlem görmüş beyaz et ürünlerimize ilişkin yayımlamış olduğu son kararına istinaden, başta ısıl işlem görmüş ürünler olmak üzere söz konusu yasakların kaldırılmasıyla ilgili olarak çaba ve girişimlerimiz devam etmektedir.
Her iki ülkenin olumlu yaklaşımları sonucunda yukarıda belirtilen çapraz menşe protokolü 11 Kasım 2008 tarihinde Ankara’da imzalanmış ve 1 Temmuz 2009 tarihi itibariyle yürürlüğe girmiştir.
Buna göre, tarım ve çelik ürünleri hariç Türkiye’den Makedonya’ya gönderilecek ara malların Makedonya’da işlenerek nihai ürün haline getirilmesi ve AB ülkelerine Makedonya’dan gümrüksüz ihraç edilmesi mümkün hale gelmiş bulunmaktadır
