Kuzey Makedonya'da en yaygın din, etnik Makedonların çoğunun bağlı olduğu Ortodoks Hristiyanlıktır. Ülkedeki Ortodoks Hristiyanların büyük çoğunluğu 1967'de Sırp Ortodoks Kilisesi'nden otosefallik ilan eden Makedon Ortodoks Kilisesi'ne tabidir. Müslümanlar, çoğunlukla ülkedeki Arnavut ve Türk azınlıklardan oluşan, nüfusun neredeyse üçte birini kapsayan ülkenin ikinci en büyük dini topluluğudur. Kuzey Makedonya'da Katolikler, Protestanlar ve Museviler gibi pek çok dini grup var.Müsluman nufus yuzde 33 civarıdır.
